ให้ความรู้เกี่ยวกับต้นไม้

เชื้อโรคชนิดใหม่ "ต้นไม้แห่งชีวิต" ให้ข้อมูลมากมายเกี่ยวกับแต่ละสายพันธุ์ที่อธิบายอย่างเป็นทางการมากกว่า 192 สายพันธุ์ รวมถึงประวัติวิวัฒนาการและความสัมพันธ์ภายในกลุ่ม รวมถึงแท็กซ่าที่อธิบายอย่างไม่เป็นทางการอีกกว่า 30 สายพันธุ์ นอกจากนี้ยังรวมข้อมูลลำดับพันธุกรรมจากหลายตำแหน่งในพิมพ์เขียวหรือจีโนมของแต่ละสปีชีส์ ข้อมูลสำคัญอื่นๆ ได้แก่ ตำแหน่งทั่วโลกของสิ่งมีชีวิตแต่ละชนิด พืชที่เป็นที่อยู่ของเชื้อโรค และตำแหน่งที่เชื้อโรคอาศัยอยู่ในหรือบนพืชที่เป็นโฮสต์ของมัน Jean Ristaino, William Neal Reynolds กล่าวว่า "เรากำลังนำสายพันธุ์ Phytophthora ที่รู้จักทั้งหมดมาใส่ไว้ใน 'ต้นไม้แห่งชีวิต' ที่มีชีวิต โดยใช้ชุดเครื่องมือ Tree-Based Alignment Selector (T-BAS) ที่พัฒนาโดย Ignazio Carbone เพื่อนร่วมงานของฉัน"ศาสตราจารย์โรคพืชดีเด่นที่ North Carolina State University และผู้เขียนบทความที่เกี่ยวข้องในPLOS ONEที่อธิบายถึงเครื่องมือ "นักวิจัยสามารถวางสายพันธุ์ภัยคุกคามที่เกิดขึ้นใหม่ลงในโครงสร้างแบบเปิดและดูว่ากลุ่มใดกำลังขยายและพัฒนา" เครื่องมือใหม่นี้จะช่วยให้นักวิจัยสามารถอัปเดตข้อมูลโรคพืชได้แบบเรียลไทม์ "กุญแจสำคัญที่แท้จริงในการป้องกันการระบาดของโรคคือการจับสัญญาณก่อนที่จะเกิดการระบาด" Ristaino ผู้กำกับคลัสเตอร์โรคพืชเกิดใหม่แห่งรัฐนอร์ทแคโรไลนาและความมั่นคงด้านอาหารโลกกล่าว "T-BAS อาจมีประโยชน์ในฐานะเครื่องมือในการเฝ้าระวังโรคและเพื่อค้นหาสายเลือดใหม่ที่อาจเกิดขึ้น นักวิจัยสามารถสอบถามฐานข้อมูลนี้และ ต้นไม้ จะรวมสายพันธุ์ใหม่" ชนิดแรกในสกุลPhytophthoraหรือ "ตัวทำลายพืช" ได้รับการอธิบายและตั้งชื่อในปี พ.ศ. 2419 Phytophthoraมีอยู่ทั่วไปในอากาศ ดิน และน้ำ และสามารถทำให้เกิดโรคในพืชอาหาร ไม้ประดับ และต้นไม้ " มีการค้นพบPhytophthora สปีชีส์ ใหม่ประมาณ 150 สายพันธุ์ตั้งแต่ปี 2000" NC State Ph.D. กล่าว นักเรียน Allison Coomber ผู้พัฒนาเครื่องมือร่วมกับทีม "นี่เป็นสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคพืชจำนวนมากผิดปกติ" Ristaino กล่าว " ไฟทอฟธอรา หลายสปี ชีส์มีโฮสต์ที่กว้าง ดังนั้นพวกมันจึงสามารถ 'ย้าย' ไปทั่วบริเวณได้กว้างกว่า" Ristaino ซึ่งตีพิมพ์บทความใน Nature ในปี 2544 ระบุสายพันธุ์ของPhytophthora infestansที่ก่อให้เกิดความอดอยากมันฝรั่งในไอร์แลนด์ หวังว่าจะรวมแผนที่ทางกายภาพกับข้อมูล T-BAS เพื่อช่วยให้การตรวจสอบเชื้อโรคระหว่างรัฐหรือประเทศต่างๆ ดีขึ้น "เราได้ขุดข้อมูลที่เผยแพร่ทั้งหมดเกี่ยวกับPhytophthora " Ristaino กล่าว "การทำงานร่วมกันและการแบ่งปันข้อมูลมีความหมายมากกว่าการเป็นความลับ"